Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX47

MARCH5, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH5, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH5Q9NX47 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARCH5Q9NX47 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MARCH5Q9NX47 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MARCH5Q9NX47 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MARCH5Q9NX47 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MARCH5Q9NX47 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MARCH5Q9NX47 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MARCH5Q9NX47 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MARCH5Q9NX47 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MARCH5Q9NX47 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MARCH5Q9NX47 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms