Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS98

SEMA3G, Semaphorin-3G, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3GQ9NS98 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA3GQ9NS98 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA3GQ9NS98 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA3GQ9NS98 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA3GQ9NS98 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3GQ9NS98 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms