Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS71

GKN1, Gastrokine-1, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKN1Q9NS71 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms