Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TULP4Q9NRJ4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TULP4Q9NRJ4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
TULP4Q9NRJ4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
TULP4Q9NRJ4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
TULP4Q9NRJ4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TULP4Q9NRJ4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TULP4Q9NRJ4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TULP4Q9NRJ4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
TULP4Q9NRJ4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TULP4Q9NRJ4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TULP4Q9NRJ4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TULP4Q9NRJ4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TULP4Q9NRJ4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
TULP4Q9NRJ4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TULP4Q9NRJ4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TULP4Q9NRJ4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TULP4Q9NRJ4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TULP4Q9NRJ4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TULP4Q9NRJ4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TULP4Q9NRJ4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TULP4Q9NRJ4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TULP4Q9NRJ4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TULP4Q9NRJ4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TULP4Q9NRJ4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TULP4Q9NRJ4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TULP4Q9NRJ4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TULP4Q9NRJ4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TULP4Q9NRJ4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TULP4Q9NRJ4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TULP4Q9NRJ4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
TULP4Q9NRJ4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TULP4Q9NRJ4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TULP4Q9NRJ4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TULP4Q9NRJ4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TULP4Q9NRJ4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TULP4Q9NRJ4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
TULP4Q9NRJ4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
TULP4Q9NRJ4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.32
TULP4Q9NRJ4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
TULP4Q9NRJ4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
TULP4Q9NRJ4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
TULP4Q9NRJ4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
TULP4Q9NRJ4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TULP4Q9NRJ4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TULP4Q9NRJ4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TULP4Q9NRJ4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
TULP4Q9NRJ4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TULP4Q9NRJ4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TULP4Q9NRJ4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
TULP4Q9NRJ4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TULP4Q9NRJ4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TULP4Q9NRJ4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TULP4Q9NRJ4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
TULP4Q9NRJ4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TULP4Q9NRJ4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TULP4Q9NRJ4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TULP4Q9NRJ4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TULP4Q9NRJ4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TULP4Q9NRJ4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TULP4Q9NRJ4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TULP4Q9NRJ4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TULP4Q9NRJ4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TULP4Q9NRJ4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TULP4Q9NRJ4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TULP4Q9NRJ4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TULP4Q9NRJ4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TULP4Q9NRJ4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TULP4Q9NRJ4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TULP4Q9NRJ4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TULP4Q9NRJ4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TULP4Q9NRJ4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TULP4Q9NRJ4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TULP4Q9NRJ4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TULP4Q9NRJ4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
TULP4Q9NRJ4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TULP4Q9NRJ4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TULP4Q9NRJ4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TULP4Q9NRJ4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TULP4Q9NRJ4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TULP4Q9NRJ4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
TULP4Q9NRJ4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TULP4Q9NRJ4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
TULP4Q9NRJ4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TULP4Q9NRJ4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TULP4Q9NRJ4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
TULP4Q9NRJ4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
TULP4Q9NRJ4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TULP4Q9NRJ4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TULP4Q9NRJ4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
TULP4Q9NRJ4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TULP4Q9NRJ4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TULP4Q9NRJ4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TULP4Q9NRJ4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TULP4Q9NRJ4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TULP4Q9NRJ4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TULP4Q9NRJ4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TULP4Q9NRJ4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TULP4Q9NRJ4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TULP4Q9NRJ4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms