Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ3

CCL28, C-C motif chemokine 28, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL28Q9NRJ3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL28Q9NRJ3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms