Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG0

CHRAC1, Chromatin accessibility complex protein 1, humanhuman

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Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRAC1Q9NRG0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
CHRAC1Q9NRG0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CHRAC1Q9NRG0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHRAC1Q9NRG0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHRAC1Q9NRG0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHRAC1Q9NRG0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHRAC1Q9NRG0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHRAC1Q9NRG0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHRAC1Q9NRG0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHRAC1Q9NRG0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHRAC1Q9NRG0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHRAC1Q9NRG0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHRAC1Q9NRG0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CHRAC1Q9NRG0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHRAC1Q9NRG0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CHRAC1Q9NRG0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHRAC1Q9NRG0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CHRAC1Q9NRG0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CHRAC1Q9NRG0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHRAC1Q9NRG0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHRAC1Q9NRG0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHRAC1Q9NRG0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRAC1Q9NRG0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRAC1Q9NRG0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHRAC1Q9NRG0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHRAC1Q9NRG0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRAC1Q9NRG0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHRAC1Q9NRG0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRAC1Q9NRG0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHRAC1Q9NRG0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CHRAC1Q9NRG0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRAC1Q9NRG0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRAC1Q9NRG0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHRAC1Q9NRG0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHRAC1Q9NRG0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHRAC1Q9NRG0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHRAC1Q9NRG0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHRAC1Q9NRG0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHRAC1Q9NRG0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHRAC1Q9NRG0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHRAC1Q9NRG0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHRAC1Q9NRG0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CHRAC1Q9NRG0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHRAC1Q9NRG0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHRAC1Q9NRG0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CHRAC1Q9NRG0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHRAC1Q9NRG0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHRAC1Q9NRG0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRAC1Q9NRG0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRAC1Q9NRG0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRAC1Q9NRG0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRAC1Q9NRG0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRAC1Q9NRG0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRAC1Q9NRG0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRAC1Q9NRG0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRAC1Q9NRG0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRAC1Q9NRG0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
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