Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
DUOX2Q9NRD8 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
DUOX2Q9NRD8 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
DUOX2Q9NRD8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
DUOX2Q9NRD8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
DUOX2Q9NRD8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
DUOX2Q9NRD8 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
DUOX2Q9NRD8 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
DUOX2Q9NRD8 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
DUOX2Q9NRD8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
DUOX2Q9NRD8 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
DUOX2Q9NRD8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
DUOX2Q9NRD8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
DUOX2Q9NRD8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
DUOX2Q9NRD8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
DUOX2Q9NRD8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
DUOX2Q9NRD8 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
DUOX2Q9NRD8 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
DUOX2Q9NRD8 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
DUOX2Q9NRD8 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC31.56■■■□□ 2.64
DUOX2Q9NRD8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
DUOX2Q9NRD8 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
DUOX2Q9NRD8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
DUOX2Q9NRD8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
DUOX2Q9NRD8 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
DUOX2Q9NRD8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC31.55■■■□□ 2.64
DUOX2Q9NRD8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
DUOX2Q9NRD8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
DUOX2Q9NRD8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
DUOX2Q9NRD8 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
DUOX2Q9NRD8 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
DUOX2Q9NRD8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
DUOX2Q9NRD8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
DUOX2Q9NRD8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
DUOX2Q9NRD8 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
DUOX2Q9NRD8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
DUOX2Q9NRD8 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
DUOX2Q9NRD8 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
DUOX2Q9NRD8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
DUOX2Q9NRD8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
DUOX2Q9NRD8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
DUOX2Q9NRD8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
DUOX2Q9NRD8 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
DUOX2Q9NRD8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
DUOX2Q9NRD8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
DUOX2Q9NRD8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
DUOX2Q9NRD8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
DUOX2Q9NRD8 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
DUOX2Q9NRD8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
DUOX2Q9NRD8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
DUOX2Q9NRD8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
DUOX2Q9NRD8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
DUOX2Q9NRD8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
DUOX2Q9NRD8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
DUOX2Q9NRD8 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
DUOX2Q9NRD8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
DUOX2Q9NRD8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
DUOX2Q9NRD8 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
DUOX2Q9NRD8 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
DUOX2Q9NRD8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
DUOX2Q9NRD8 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
DUOX2Q9NRD8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
DUOX2Q9NRD8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC31.51■■■□□ 2.63
DUOX2Q9NRD8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
DUOX2Q9NRD8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
DUOX2Q9NRD8 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
DUOX2Q9NRD8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
DUOX2Q9NRD8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
DUOX2Q9NRD8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
DUOX2Q9NRD8 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
DUOX2Q9NRD8 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
DUOX2Q9NRD8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
DUOX2Q9NRD8 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
DUOX2Q9NRD8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
DUOX2Q9NRD8 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
DUOX2Q9NRD8 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
DUOX2Q9NRD8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC31.49■■■□□ 2.63
DUOX2Q9NRD8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
DUOX2Q9NRD8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
DUOX2Q9NRD8 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
DUOX2Q9NRD8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
DUOX2Q9NRD8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
DUOX2Q9NRD8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
DUOX2Q9NRD8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
DUOX2Q9NRD8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
DUOX2Q9NRD8 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.49■■■□□ 2.63
DUOX2Q9NRD8 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
DUOX2Q9NRD8 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC31.49■■■□□ 2.63
DUOX2Q9NRD8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
DUOX2Q9NRD8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
DUOX2Q9NRD8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
DUOX2Q9NRD8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
DUOX2Q9NRD8 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
DUOX2Q9NRD8 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
DUOX2Q9NRD8 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
DUOX2Q9NRD8 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
DUOX2Q9NRD8 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
DUOX2Q9NRD8 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
DUOX2Q9NRD8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
DUOX2Q9NRD8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms