Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR33

POLE4, DNA polymerase epsilon subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE4Q9NR33 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLE4Q9NR33 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms