Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 KC6-207ENST00000600644 2311 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms