Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LHX9Q9NQ69 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms