Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TIMMDC1Q9NPL8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TIMMDC1Q9NPL8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TIMMDC1Q9NPL8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TIMMDC1Q9NPL8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TIMMDC1Q9NPL8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TIMMDC1Q9NPL8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TIMMDC1Q9NPL8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TIMMDC1Q9NPL8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TIMMDC1Q9NPL8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TIMMDC1Q9NPL8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms