Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG4

PCDH12, Protocadherin-12, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH12Q9NPG4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms