Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4W6

EBF3, Transcription factor COE3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF3Q9H4W6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EBF3Q9H4W6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EBF3Q9H4W6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EBF3Q9H4W6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EBF3Q9H4W6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EBF3Q9H4W6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EBF3Q9H4W6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EBF3Q9H4W6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EBF3Q9H4W6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EBF3Q9H4W6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EBF3Q9H4W6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EBF3Q9H4W6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EBF3Q9H4W6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EBF3Q9H4W6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EBF3Q9H4W6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EBF3Q9H4W6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EBF3Q9H4W6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EBF3Q9H4W6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EBF3Q9H4W6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EBF3Q9H4W6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EBF3Q9H4W6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EBF3Q9H4W6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EBF3Q9H4W6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EBF3Q9H4W6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EBF3Q9H4W6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EBF3Q9H4W6 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EBF3Q9H4W6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EBF3Q9H4W6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EBF3Q9H4W6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EBF3Q9H4W6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EBF3Q9H4W6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EBF3Q9H4W6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EBF3Q9H4W6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EBF3Q9H4W6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EBF3Q9H4W6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EBF3Q9H4W6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EBF3Q9H4W6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EBF3Q9H4W6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EBF3Q9H4W6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EBF3Q9H4W6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EBF3Q9H4W6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EBF3Q9H4W6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EBF3Q9H4W6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EBF3Q9H4W6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EBF3Q9H4W6 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EBF3Q9H4W6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EBF3Q9H4W6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EBF3Q9H4W6 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EBF3Q9H4W6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EBF3Q9H4W6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EBF3Q9H4W6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EBF3Q9H4W6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EBF3Q9H4W6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EBF3Q9H4W6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EBF3Q9H4W6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EBF3Q9H4W6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EBF3Q9H4W6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EBF3Q9H4W6 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EBF3Q9H4W6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EBF3Q9H4W6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EBF3Q9H4W6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EBF3Q9H4W6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EBF3Q9H4W6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EBF3Q9H4W6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EBF3Q9H4W6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EBF3Q9H4W6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EBF3Q9H4W6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EBF3Q9H4W6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EBF3Q9H4W6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EBF3Q9H4W6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EBF3Q9H4W6 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EBF3Q9H4W6 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EBF3Q9H4W6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
EBF3Q9H4W6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
EBF3Q9H4W6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EBF3Q9H4W6 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EBF3Q9H4W6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EBF3Q9H4W6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EBF3Q9H4W6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EBF3Q9H4W6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EBF3Q9H4W6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EBF3Q9H4W6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
EBF3Q9H4W6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms