Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K3

ACTR3C, Actin-related protein 3C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3CQ9C0K3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTR3CQ9C0K3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTR3CQ9C0K3 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTR3CQ9C0K3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTR3CQ9C0K3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTR3CQ9C0K3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTR3CQ9C0K3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTR3CQ9C0K3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTR3CQ9C0K3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTR3CQ9C0K3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTR3CQ9C0K3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTR3CQ9C0K3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTR3CQ9C0K3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTR3CQ9C0K3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTR3CQ9C0K3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTR3CQ9C0K3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTR3CQ9C0K3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTR3CQ9C0K3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTR3CQ9C0K3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTR3CQ9C0K3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTR3CQ9C0K3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTR3CQ9C0K3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTR3CQ9C0K3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTR3CQ9C0K3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTR3CQ9C0K3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTR3CQ9C0K3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTR3CQ9C0K3 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTR3CQ9C0K3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTR3CQ9C0K3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTR3CQ9C0K3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTR3CQ9C0K3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTR3CQ9C0K3 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTR3CQ9C0K3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTR3CQ9C0K3 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTR3CQ9C0K3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTR3CQ9C0K3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTR3CQ9C0K3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTR3CQ9C0K3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTR3CQ9C0K3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTR3CQ9C0K3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTR3CQ9C0K3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTR3CQ9C0K3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTR3CQ9C0K3 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTR3CQ9C0K3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTR3CQ9C0K3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTR3CQ9C0K3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTR3CQ9C0K3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTR3CQ9C0K3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTR3CQ9C0K3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTR3CQ9C0K3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTR3CQ9C0K3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTR3CQ9C0K3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTR3CQ9C0K3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTR3CQ9C0K3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTR3CQ9C0K3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTR3CQ9C0K3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTR3CQ9C0K3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTR3CQ9C0K3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTR3CQ9C0K3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTR3CQ9C0K3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTR3CQ9C0K3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTR3CQ9C0K3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTR3CQ9C0K3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTR3CQ9C0K3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTR3CQ9C0K3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTR3CQ9C0K3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTR3CQ9C0K3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTR3CQ9C0K3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTR3CQ9C0K3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTR3CQ9C0K3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTR3CQ9C0K3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTR3CQ9C0K3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTR3CQ9C0K3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACTR3CQ9C0K3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACTR3CQ9C0K3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACTR3CQ9C0K3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACTR3CQ9C0K3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACTR3CQ9C0K3 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACTR3CQ9C0K3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACTR3CQ9C0K3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACTR3CQ9C0K3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTR3CQ9C0K3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTR3CQ9C0K3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTR3CQ9C0K3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTR3CQ9C0K3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTR3CQ9C0K3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTR3CQ9C0K3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTR3CQ9C0K3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTR3CQ9C0K3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTR3CQ9C0K3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTR3CQ9C0K3 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTR3CQ9C0K3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTR3CQ9C0K3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTR3CQ9C0K3 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTR3CQ9C0K3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTR3CQ9C0K3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTR3CQ9C0K3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTR3CQ9C0K3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTR3CQ9C0K3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTR3CQ9C0K3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms