Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CARD11Q9BXL7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CARD11Q9BXL7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CARD11Q9BXL7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CARD11Q9BXL7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CARD11Q9BXL7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CARD11Q9BXL7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CARD11Q9BXL7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CARD11Q9BXL7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CARD11Q9BXL7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CARD11Q9BXL7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CARD11Q9BXL7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CARD11Q9BXL7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CARD11Q9BXL7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CARD11Q9BXL7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CARD11Q9BXL7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
CARD11Q9BXL7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CARD11Q9BXL7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CARD11Q9BXL7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CARD11Q9BXL7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
CARD11Q9BXL7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CARD11Q9BXL7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
CARD11Q9BXL7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CARD11Q9BXL7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CARD11Q9BXL7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CARD11Q9BXL7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CARD11Q9BXL7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
CARD11Q9BXL7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CARD11Q9BXL7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CARD11Q9BXL7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CARD11Q9BXL7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CARD11Q9BXL7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CARD11Q9BXL7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CARD11Q9BXL7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CARD11Q9BXL7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CARD11Q9BXL7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CARD11Q9BXL7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CARD11Q9BXL7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CARD11Q9BXL7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CARD11Q9BXL7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CARD11Q9BXL7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CARD11Q9BXL7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CARD11Q9BXL7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CARD11Q9BXL7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CARD11Q9BXL7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CARD11Q9BXL7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CARD11Q9BXL7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CARD11Q9BXL7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CARD11Q9BXL7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CARD11Q9BXL7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CARD11Q9BXL7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CARD11Q9BXL7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CARD11Q9BXL7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CARD11Q9BXL7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CARD11Q9BXL7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
CARD11Q9BXL7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
CARD11Q9BXL7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CARD11Q9BXL7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CARD11Q9BXL7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CARD11Q9BXL7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CARD11Q9BXL7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CARD11Q9BXL7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CARD11Q9BXL7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CARD11Q9BXL7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CARD11Q9BXL7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CARD11Q9BXL7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CARD11Q9BXL7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CARD11Q9BXL7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CARD11Q9BXL7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CARD11Q9BXL7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CARD11Q9BXL7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CARD11Q9BXL7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CARD11Q9BXL7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CARD11Q9BXL7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CARD11Q9BXL7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CARD11Q9BXL7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CARD11Q9BXL7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CARD11Q9BXL7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CARD11Q9BXL7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CARD11Q9BXL7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
CARD11Q9BXL7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CARD11Q9BXL7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CARD11Q9BXL7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CARD11Q9BXL7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CARD11Q9BXL7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CARD11Q9BXL7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CARD11Q9BXL7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CARD11Q9BXL7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CARD11Q9BXL7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CARD11Q9BXL7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CARD11Q9BXL7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CARD11Q9BXL7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
CARD11Q9BXL7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CARD11Q9BXL7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CARD11Q9BXL7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CARD11Q9BXL7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CARD11Q9BXL7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CARD11Q9BXL7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CARD11Q9BXL7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CARD11Q9BXL7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms