Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BBS2Q9BXC9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms