Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUK0

CHCHD7, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 7, humanhuman

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD7Q9BUK0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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