Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
MTA3Q9BTC8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms