Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms