Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR77

CCDC77, Coiled-coil domain-containing protein 77, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC77Q9BR77 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC77Q9BR77 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms