Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS2

SYT15, Synaptotagmin-15, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT15Q9BQS2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYT15Q9BQS2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYT15Q9BQS2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYT15Q9BQS2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYT15Q9BQS2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYT15Q9BQS2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYT15Q9BQS2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYT15Q9BQS2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYT15Q9BQS2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYT15Q9BQS2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYT15Q9BQS2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYT15Q9BQS2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYT15Q9BQS2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYT15Q9BQS2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYT15Q9BQS2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYT15Q9BQS2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT15Q9BQS2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT15Q9BQS2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT15Q9BQS2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT15Q9BQS2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT15Q9BQS2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT15Q9BQS2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT15Q9BQS2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT15Q9BQS2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT15Q9BQS2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT15Q9BQS2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT15Q9BQS2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT15Q9BQS2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT15Q9BQS2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT15Q9BQS2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT15Q9BQS2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT15Q9BQS2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT15Q9BQS2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT15Q9BQS2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT15Q9BQS2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT15Q9BQS2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT15Q9BQS2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT15Q9BQS2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT15Q9BQS2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT15Q9BQS2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT15Q9BQS2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT15Q9BQS2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYT15Q9BQS2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SYT15Q9BQS2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SYT15Q9BQS2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYT15Q9BQS2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYT15Q9BQS2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYT15Q9BQS2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYT15Q9BQS2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYT15Q9BQS2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SYT15Q9BQS2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYT15Q9BQS2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SYT15Q9BQS2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYT15Q9BQS2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYT15Q9BQS2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYT15Q9BQS2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYT15Q9BQS2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYT15Q9BQS2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYT15Q9BQS2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYT15Q9BQS2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYT15Q9BQS2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYT15Q9BQS2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYT15Q9BQS2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYT15Q9BQS2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYT15Q9BQS2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYT15Q9BQS2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYT15Q9BQS2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYT15Q9BQS2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYT15Q9BQS2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYT15Q9BQS2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYT15Q9BQS2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYT15Q9BQS2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYT15Q9BQS2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYT15Q9BQS2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYT15Q9BQS2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYT15Q9BQS2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYT15Q9BQS2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYT15Q9BQS2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYT15Q9BQS2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYT15Q9BQS2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYT15Q9BQS2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYT15Q9BQS2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYT15Q9BQS2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYT15Q9BQS2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT15Q9BQS2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT15Q9BQS2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT15Q9BQS2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT15Q9BQS2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT15Q9BQS2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT15Q9BQS2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT15Q9BQS2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT15Q9BQS2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT15Q9BQS2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT15Q9BQS2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT15Q9BQS2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT15Q9BQS2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT15Q9BQS2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT15Q9BQS2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT15Q9BQS2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT15Q9BQS2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms