Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 CALB1-208ENST00000518457 1490 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC011374.1-201ENST00000564471 1567 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01747-203ENST00000634603 1377 ntTSL 4 BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 NDUFB5-201ENST00000259037 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 CLDN17-201ENST00000286808 1193 ntAPPRIS P1 BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 REG1B-201ENST00000305089 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 UBE2D3-204ENST00000349311 838 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 TMED5-201ENST00000370280 750 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF705B-201ENST00000400120 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 SOX9-AS1-202ENST00000414600 742 ntTSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC073188.3-201ENST00000425228 339 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00462-201ENST00000425350 962 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 NDUFA5P8-201ENST00000449019 346 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC023590.1-203ENST00000449065 411 ntTSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 KIF3AP1-201ENST00000454055 611 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC127537.3-201ENST00000566532 749 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC073911.1-201ENST00000592296 504 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC027271.1-201ENST00000610270 610 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC012313.9-201ENST00000619318 633 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01358-209ENST00000635072 1114 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC119674.1-209ENST00000642031 997 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 JCHAIN-201ENST00000254801 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 MS4A6E-201ENST00000300182 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 SUMO1-206ENST00000409368 1187 ntTSL 4 BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 PCBP1-AS1-242ENST00000458686 1020 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 CRYAB-205ENST00000526180 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC084033.1-201ENST00000550830 633 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AP005202.1-202ENST00000583065 748 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC005954.2-201ENST00000586503 556 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 CCL4L2-210ENST00000610565 785 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 CCL4L2-211ENST00000613173 741 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 CCL4L2-212ENST00000615418 954 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 CCL4L2-213ENST00000617405 846 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 CCL4L2-216ENST00000620098 836 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 CCL4L2-218ENST00000620576 652 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 CCL4L2-219ENST00000620732 856 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP4-12Q9BQ66 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
KRTAP4-12Q9BQ66 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP4-12Q9BQ66 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP4-12Q9BQ66 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP4-12Q9BQ66 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP4-12Q9BQ66 CYB5A-201ENST00000299438 718 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP4-12Q9BQ66 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP4-12Q9BQ66 TSACC-201ENST00000368251 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms