Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms