Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPX3

NCAPG, Condensin complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPGQ9BPX3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCAPGQ9BPX3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCAPGQ9BPX3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCAPGQ9BPX3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCAPGQ9BPX3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCAPGQ9BPX3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCAPGQ9BPX3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCAPGQ9BPX3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCAPGQ9BPX3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NCAPGQ9BPX3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NCAPGQ9BPX3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCAPGQ9BPX3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCAPGQ9BPX3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCAPGQ9BPX3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCAPGQ9BPX3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCAPGQ9BPX3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCAPGQ9BPX3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NCAPGQ9BPX3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCAPGQ9BPX3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCAPGQ9BPX3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCAPGQ9BPX3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCAPGQ9BPX3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCAPGQ9BPX3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCAPGQ9BPX3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NCAPGQ9BPX3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCAPGQ9BPX3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCAPGQ9BPX3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCAPGQ9BPX3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCAPGQ9BPX3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NCAPGQ9BPX3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCAPGQ9BPX3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NCAPGQ9BPX3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCAPGQ9BPX3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCAPGQ9BPX3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCAPGQ9BPX3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCAPGQ9BPX3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCAPGQ9BPX3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCAPGQ9BPX3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCAPGQ9BPX3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCAPGQ9BPX3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NCAPGQ9BPX3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NCAPGQ9BPX3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NCAPGQ9BPX3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NCAPGQ9BPX3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NCAPGQ9BPX3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms