Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
EYA3Q99504 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EYA3Q99504 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EYA3Q99504 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EYA3Q99504 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EYA3Q99504 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EYA3Q99504 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EYA3Q99504 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EYA3Q99504 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EYA3Q99504 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EYA3Q99504 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EYA3Q99504 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EYA3Q99504 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EYA3Q99504 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
EYA3Q99504 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EYA3Q99504 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EYA3Q99504 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EYA3Q99504 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
EYA3Q99504 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EYA3Q99504 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EYA3Q99504 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EYA3Q99504 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EYA3Q99504 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EYA3Q99504 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
EYA3Q99504 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EYA3Q99504 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EYA3Q99504 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EYA3Q99504 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EYA3Q99504 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EYA3Q99504 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EYA3Q99504 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EYA3Q99504 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EYA3Q99504 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
EYA3Q99504 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EYA3Q99504 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EYA3Q99504 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EYA3Q99504 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EYA3Q99504 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EYA3Q99504 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EYA3Q99504 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EYA3Q99504 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EYA3Q99504 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EYA3Q99504 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EYA3Q99504 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EYA3Q99504 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EYA3Q99504 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EYA3Q99504 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EYA3Q99504 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EYA3Q99504 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EYA3Q99504 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EYA3Q99504 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EYA3Q99504 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EYA3Q99504 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EYA3Q99504 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EYA3Q99504 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EYA3Q99504 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
EYA3Q99504 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EYA3Q99504 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EYA3Q99504 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EYA3Q99504 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EYA3Q99504 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms