Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CRBNQ96SW2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CRBNQ96SW2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CRBNQ96SW2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CRBNQ96SW2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CRBNQ96SW2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CRBNQ96SW2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CRBNQ96SW2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CRBNQ96SW2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CRBNQ96SW2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CRBNQ96SW2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CRBNQ96SW2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CRBNQ96SW2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CRBNQ96SW2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CRBNQ96SW2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CRBNQ96SW2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CRBNQ96SW2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CRBNQ96SW2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CRBNQ96SW2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CRBNQ96SW2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CRBNQ96SW2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CRBNQ96SW2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CRBNQ96SW2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CRBNQ96SW2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CRBNQ96SW2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CRBNQ96SW2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CRBNQ96SW2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CRBNQ96SW2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CRBNQ96SW2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CRBNQ96SW2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CRBNQ96SW2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CRBNQ96SW2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CRBNQ96SW2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CRBNQ96SW2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CRBNQ96SW2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CRBNQ96SW2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CRBNQ96SW2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CRBNQ96SW2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CRBNQ96SW2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CRBNQ96SW2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CRBNQ96SW2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CRBNQ96SW2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CRBNQ96SW2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CRBNQ96SW2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CRBNQ96SW2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CRBNQ96SW2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CRBNQ96SW2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CRBNQ96SW2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CRBNQ96SW2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CRBNQ96SW2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CRBNQ96SW2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CRBNQ96SW2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CRBNQ96SW2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CRBNQ96SW2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CRBNQ96SW2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms