Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms