Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC4A9Q96Q91 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC4A9Q96Q91 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC4A9Q96Q91 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC4A9Q96Q91 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC4A9Q96Q91 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC4A9Q96Q91 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC4A9Q96Q91 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC4A9Q96Q91 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC4A9Q96Q91 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC4A9Q96Q91 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC4A9Q96Q91 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC4A9Q96Q91 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC4A9Q96Q91 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC4A9Q96Q91 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC4A9Q96Q91 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC4A9Q96Q91 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC4A9Q96Q91 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC4A9Q96Q91 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC4A9Q96Q91 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC4A9Q96Q91 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC4A9Q96Q91 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC4A9Q96Q91 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC4A9Q96Q91 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC4A9Q96Q91 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC4A9Q96Q91 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC4A9Q96Q91 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC4A9Q96Q91 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC4A9Q96Q91 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC4A9Q96Q91 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC4A9Q96Q91 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC4A9Q96Q91 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC4A9Q96Q91 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC4A9Q96Q91 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC4A9Q96Q91 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC4A9Q96Q91 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC4A9Q96Q91 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC4A9Q96Q91 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC4A9Q96Q91 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC4A9Q96Q91 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC4A9Q96Q91 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC4A9Q96Q91 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC4A9Q96Q91 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC4A9Q96Q91 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC4A9Q96Q91 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC4A9Q96Q91 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC4A9Q96Q91 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC4A9Q96Q91 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC4A9Q96Q91 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC4A9Q96Q91 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC4A9Q96Q91 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC4A9Q96Q91 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC4A9Q96Q91 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC4A9Q96Q91 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC4A9Q96Q91 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC4A9Q96Q91 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC4A9Q96Q91 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC4A9Q96Q91 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC4A9Q96Q91 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC4A9Q96Q91 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC4A9Q96Q91 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC4A9Q96Q91 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC4A9Q96Q91 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC4A9Q96Q91 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC4A9Q96Q91 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC4A9Q96Q91 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC4A9Q96Q91 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC4A9Q96Q91 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC4A9Q96Q91 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC4A9Q96Q91 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC4A9Q96Q91 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC4A9Q96Q91 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC4A9Q96Q91 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC4A9Q96Q91 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC4A9Q96Q91 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC4A9Q96Q91 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC4A9Q96Q91 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SLC4A9Q96Q91 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC4A9Q96Q91 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC4A9Q96Q91 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC4A9Q96Q91 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC4A9Q96Q91 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC4A9Q96Q91 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC4A9Q96Q91 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC4A9Q96Q91 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC4A9Q96Q91 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC4A9Q96Q91 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC4A9Q96Q91 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC4A9Q96Q91 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC4A9Q96Q91 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC4A9Q96Q91 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC4A9Q96Q91 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC4A9Q96Q91 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC4A9Q96Q91 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC4A9Q96Q91 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC4A9Q96Q91 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC4A9Q96Q91 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC4A9Q96Q91 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC4A9Q96Q91 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC4A9Q96Q91 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms