Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT0

CCDC115, Coiled-coil domain-containing protein 115, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC115Q96NT0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms