Protein–RNA interactions for Protein: Q96NF6

C8orf49, Putative uncharacterized protein C8orf49, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf49Q96NF6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C8orf49Q96NF6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms