Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC7Q96M83 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC7Q96M83 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC7Q96M83 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC7Q96M83 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC7Q96M83 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC7Q96M83 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC7Q96M83 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC7Q96M83 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC7Q96M83 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC7Q96M83 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC7Q96M83 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC7Q96M83 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC7Q96M83 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC7Q96M83 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC7Q96M83 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC7Q96M83 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC7Q96M83 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC7Q96M83 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC7Q96M83 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC7Q96M83 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC7Q96M83 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC7Q96M83 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC7Q96M83 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC7Q96M83 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC7Q96M83 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC7Q96M83 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC7Q96M83 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC7Q96M83 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC7Q96M83 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CCDC7Q96M83 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CCDC7Q96M83 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CCDC7Q96M83 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC7Q96M83 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC7Q96M83 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC7Q96M83 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC7Q96M83 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC7Q96M83 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC7Q96M83 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC7Q96M83 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC7Q96M83 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC7Q96M83 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC7Q96M83 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC7Q96M83 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC7Q96M83 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC7Q96M83 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC7Q96M83 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC7Q96M83 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC7Q96M83 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC7Q96M83 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC7Q96M83 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC7Q96M83 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC7Q96M83 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC7Q96M83 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC7Q96M83 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC7Q96M83 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC7Q96M83 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC7Q96M83 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC7Q96M83 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC7Q96M83 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC7Q96M83 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC7Q96M83 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC7Q96M83 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC7Q96M83 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC7Q96M83 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC7Q96M83 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC7Q96M83 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC7Q96M83 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC7Q96M83 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC7Q96M83 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC7Q96M83 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC7Q96M83 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC7Q96M83 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC7Q96M83 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC7Q96M83 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC7Q96M83 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC7Q96M83 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC7Q96M83 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC7Q96M83 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC7Q96M83 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC7Q96M83 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC7Q96M83 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC7Q96M83 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC7Q96M83 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC7Q96M83 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC7Q96M83 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CCDC7Q96M83 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CCDC7Q96M83 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
CCDC7Q96M83 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CCDC7Q96M83 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
CCDC7Q96M83 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC7Q96M83 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC7Q96M83 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC7Q96M83 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC7Q96M83 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC7Q96M83 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC7Q96M83 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC7Q96M83 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC7Q96M83 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC7Q96M83 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms