Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms