Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG8

MAGED4, Melanoma-associated antigen D4, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGED4Q96JG8 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MAGED4Q96JG8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms