Protein–RNA interactions for Protein: Q96F07

CYFIP2, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP2Q96F07 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYFIP2Q96F07 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYFIP2Q96F07 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYFIP2Q96F07 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYFIP2Q96F07 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYFIP2Q96F07 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYFIP2Q96F07 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYFIP2Q96F07 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYFIP2Q96F07 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYFIP2Q96F07 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYFIP2Q96F07 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYFIP2Q96F07 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYFIP2Q96F07 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYFIP2Q96F07 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYFIP2Q96F07 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYFIP2Q96F07 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYFIP2Q96F07 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYFIP2Q96F07 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYFIP2Q96F07 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYFIP2Q96F07 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYFIP2Q96F07 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYFIP2Q96F07 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYFIP2Q96F07 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYFIP2Q96F07 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYFIP2Q96F07 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYFIP2Q96F07 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYFIP2Q96F07 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYFIP2Q96F07 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CYFIP2Q96F07 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYFIP2Q96F07 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYFIP2Q96F07 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CYFIP2Q96F07 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYFIP2Q96F07 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYFIP2Q96F07 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYFIP2Q96F07 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYFIP2Q96F07 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYFIP2Q96F07 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYFIP2Q96F07 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CYFIP2Q96F07 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYFIP2Q96F07 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYFIP2Q96F07 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYFIP2Q96F07 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYFIP2Q96F07 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYFIP2Q96F07 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYFIP2Q96F07 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYFIP2Q96F07 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYFIP2Q96F07 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYFIP2Q96F07 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYFIP2Q96F07 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYFIP2Q96F07 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYFIP2Q96F07 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYFIP2Q96F07 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CYFIP2Q96F07 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYFIP2Q96F07 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYFIP2Q96F07 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYFIP2Q96F07 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYFIP2Q96F07 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYFIP2Q96F07 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYFIP2Q96F07 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYFIP2Q96F07 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYFIP2Q96F07 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYFIP2Q96F07 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYFIP2Q96F07 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYFIP2Q96F07 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYFIP2Q96F07 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYFIP2Q96F07 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYFIP2Q96F07 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYFIP2Q96F07 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYFIP2Q96F07 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYFIP2Q96F07 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYFIP2Q96F07 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYFIP2Q96F07 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYFIP2Q96F07 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYFIP2Q96F07 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYFIP2Q96F07 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYFIP2Q96F07 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYFIP2Q96F07 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYFIP2Q96F07 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYFIP2Q96F07 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CYFIP2Q96F07 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYFIP2Q96F07 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYFIP2Q96F07 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYFIP2Q96F07 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYFIP2Q96F07 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYFIP2Q96F07 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYFIP2Q96F07 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYFIP2Q96F07 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYFIP2Q96F07 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYFIP2Q96F07 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYFIP2Q96F07 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYFIP2Q96F07 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYFIP2Q96F07 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYFIP2Q96F07 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYFIP2Q96F07 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CYFIP2Q96F07 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYFIP2Q96F07 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CYFIP2Q96F07 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYFIP2Q96F07 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CYFIP2Q96F07 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CYFIP2Q96F07 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms