Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP6

GRAMD1A, GRAM domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1AQ96CP6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRAMD1AQ96CP6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms