Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms