Protein–RNA interactions for Protein: Q93038

TNFRSF25, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 25, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25Q93038 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFRSF25Q93038 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFRSF25Q93038 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFRSF25Q93038 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFRSF25Q93038 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFRSF25Q93038 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFRSF25Q93038 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFRSF25Q93038 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFRSF25Q93038 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFRSF25Q93038 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFRSF25Q93038 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFRSF25Q93038 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFRSF25Q93038 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFRSF25Q93038 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFRSF25Q93038 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFRSF25Q93038 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFRSF25Q93038 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFRSF25Q93038 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFRSF25Q93038 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFRSF25Q93038 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFRSF25Q93038 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF25Q93038 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF25Q93038 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF25Q93038 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF25Q93038 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF25Q93038 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF25Q93038 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF25Q93038 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF25Q93038 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF25Q93038 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF25Q93038 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF25Q93038 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF25Q93038 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF25Q93038 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF25Q93038 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF25Q93038 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF25Q93038 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF25Q93038 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF25Q93038 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF25Q93038 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF25Q93038 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF25Q93038 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF25Q93038 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFRSF25Q93038 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFRSF25Q93038 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFRSF25Q93038 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFRSF25Q93038 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFRSF25Q93038 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFRSF25Q93038 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFRSF25Q93038 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFRSF25Q93038 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFRSF25Q93038 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFRSF25Q93038 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFRSF25Q93038 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNFRSF25Q93038 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TNFRSF25Q93038 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNFRSF25Q93038 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNFRSF25Q93038 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNFRSF25Q93038 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TNFRSF25Q93038 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms