Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEDD1Q8NHV4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEDD1Q8NHV4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NEDD1Q8NHV4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEDD1Q8NHV4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEDD1Q8NHV4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEDD1Q8NHV4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEDD1Q8NHV4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEDD1Q8NHV4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEDD1Q8NHV4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEDD1Q8NHV4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEDD1Q8NHV4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEDD1Q8NHV4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEDD1Q8NHV4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEDD1Q8NHV4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEDD1Q8NHV4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEDD1Q8NHV4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEDD1Q8NHV4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEDD1Q8NHV4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEDD1Q8NHV4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEDD1Q8NHV4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NEDD1Q8NHV4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEDD1Q8NHV4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEDD1Q8NHV4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NEDD1Q8NHV4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEDD1Q8NHV4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEDD1Q8NHV4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEDD1Q8NHV4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEDD1Q8NHV4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEDD1Q8NHV4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEDD1Q8NHV4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEDD1Q8NHV4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEDD1Q8NHV4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEDD1Q8NHV4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEDD1Q8NHV4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEDD1Q8NHV4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NEDD1Q8NHV4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEDD1Q8NHV4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEDD1Q8NHV4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEDD1Q8NHV4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEDD1Q8NHV4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEDD1Q8NHV4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEDD1Q8NHV4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEDD1Q8NHV4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEDD1Q8NHV4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEDD1Q8NHV4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEDD1Q8NHV4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEDD1Q8NHV4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEDD1Q8NHV4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEDD1Q8NHV4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEDD1Q8NHV4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEDD1Q8NHV4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NEDD1Q8NHV4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEDD1Q8NHV4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms