Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms