Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM71DQ8N9W8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM71DQ8N9W8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM71DQ8N9W8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM71DQ8N9W8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM71DQ8N9W8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM71DQ8N9W8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM71DQ8N9W8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM71DQ8N9W8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM71DQ8N9W8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM71DQ8N9W8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM71DQ8N9W8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM71DQ8N9W8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM71DQ8N9W8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM71DQ8N9W8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM71DQ8N9W8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM71DQ8N9W8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM71DQ8N9W8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM71DQ8N9W8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM71DQ8N9W8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM71DQ8N9W8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM71DQ8N9W8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM71DQ8N9W8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM71DQ8N9W8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM71DQ8N9W8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM71DQ8N9W8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM71DQ8N9W8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM71DQ8N9W8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM71DQ8N9W8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM71DQ8N9W8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM71DQ8N9W8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM71DQ8N9W8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM71DQ8N9W8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM71DQ8N9W8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM71DQ8N9W8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM71DQ8N9W8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM71DQ8N9W8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM71DQ8N9W8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM71DQ8N9W8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM71DQ8N9W8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM71DQ8N9W8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM71DQ8N9W8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM71DQ8N9W8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM71DQ8N9W8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM71DQ8N9W8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM71DQ8N9W8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM71DQ8N9W8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM71DQ8N9W8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM71DQ8N9W8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM71DQ8N9W8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM71DQ8N9W8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM71DQ8N9W8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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