Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDCL2Q8N4E4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PDCL2Q8N4E4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDCL2Q8N4E4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDCL2Q8N4E4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDCL2Q8N4E4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDCL2Q8N4E4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDCL2Q8N4E4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDCL2Q8N4E4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDCL2Q8N4E4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDCL2Q8N4E4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PDCL2Q8N4E4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDCL2Q8N4E4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDCL2Q8N4E4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDCL2Q8N4E4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDCL2Q8N4E4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDCL2Q8N4E4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDCL2Q8N4E4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDCL2Q8N4E4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDCL2Q8N4E4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDCL2Q8N4E4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDCL2Q8N4E4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDCL2Q8N4E4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDCL2Q8N4E4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDCL2Q8N4E4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PDCL2Q8N4E4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDCL2Q8N4E4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDCL2Q8N4E4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDCL2Q8N4E4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDCL2Q8N4E4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDCL2Q8N4E4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDCL2Q8N4E4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDCL2Q8N4E4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDCL2Q8N4E4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDCL2Q8N4E4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDCL2Q8N4E4 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDCL2Q8N4E4 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDCL2Q8N4E4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDCL2Q8N4E4 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDCL2Q8N4E4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDCL2Q8N4E4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDCL2Q8N4E4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDCL2Q8N4E4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDCL2Q8N4E4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDCL2Q8N4E4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDCL2Q8N4E4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDCL2Q8N4E4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDCL2Q8N4E4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDCL2Q8N4E4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDCL2Q8N4E4 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDCL2Q8N4E4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDCL2Q8N4E4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDCL2Q8N4E4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDCL2Q8N4E4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDCL2Q8N4E4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDCL2Q8N4E4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDCL2Q8N4E4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDCL2Q8N4E4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDCL2Q8N4E4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms