Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U6

LINC00518, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00518, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00518Q8N0U6 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms