Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXH7

NELFCD, Negative elongation factor C/D, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFCDQ8IXH7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NELFCDQ8IXH7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NELFCDQ8IXH7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NELFCDQ8IXH7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NELFCDQ8IXH7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NELFCDQ8IXH7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NELFCDQ8IXH7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NELFCDQ8IXH7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NELFCDQ8IXH7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NELFCDQ8IXH7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NELFCDQ8IXH7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NELFCDQ8IXH7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NELFCDQ8IXH7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NELFCDQ8IXH7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NELFCDQ8IXH7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NELFCDQ8IXH7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NELFCDQ8IXH7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NELFCDQ8IXH7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NELFCDQ8IXH7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NELFCDQ8IXH7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NELFCDQ8IXH7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NELFCDQ8IXH7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NELFCDQ8IXH7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NELFCDQ8IXH7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NELFCDQ8IXH7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NELFCDQ8IXH7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NELFCDQ8IXH7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NELFCDQ8IXH7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NELFCDQ8IXH7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NELFCDQ8IXH7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NELFCDQ8IXH7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NELFCDQ8IXH7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms