Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWQ3

BRSK2, Serine/threonine-protein kinase BRSK2, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK2Q8IWQ3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRSK2Q8IWQ3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRSK2Q8IWQ3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRSK2Q8IWQ3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRSK2Q8IWQ3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRSK2Q8IWQ3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRSK2Q8IWQ3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRSK2Q8IWQ3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRSK2Q8IWQ3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
BRSK2Q8IWQ3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRSK2Q8IWQ3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRSK2Q8IWQ3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRSK2Q8IWQ3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRSK2Q8IWQ3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRSK2Q8IWQ3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRSK2Q8IWQ3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRSK2Q8IWQ3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRSK2Q8IWQ3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRSK2Q8IWQ3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRSK2Q8IWQ3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRSK2Q8IWQ3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRSK2Q8IWQ3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRSK2Q8IWQ3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
BRSK2Q8IWQ3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRSK2Q8IWQ3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRSK2Q8IWQ3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
BRSK2Q8IWQ3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRSK2Q8IWQ3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRSK2Q8IWQ3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRSK2Q8IWQ3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRSK2Q8IWQ3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRSK2Q8IWQ3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRSK2Q8IWQ3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRSK2Q8IWQ3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRSK2Q8IWQ3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRSK2Q8IWQ3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
BRSK2Q8IWQ3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRSK2Q8IWQ3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRSK2Q8IWQ3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRSK2Q8IWQ3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRSK2Q8IWQ3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRSK2Q8IWQ3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRSK2Q8IWQ3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRSK2Q8IWQ3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRSK2Q8IWQ3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRSK2Q8IWQ3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRSK2Q8IWQ3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRSK2Q8IWQ3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRSK2Q8IWQ3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRSK2Q8IWQ3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRSK2Q8IWQ3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRSK2Q8IWQ3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRSK2Q8IWQ3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRSK2Q8IWQ3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRSK2Q8IWQ3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BRSK2Q8IWQ3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRSK2Q8IWQ3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRSK2Q8IWQ3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRSK2Q8IWQ3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRSK2Q8IWQ3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRSK2Q8IWQ3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRSK2Q8IWQ3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRSK2Q8IWQ3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRSK2Q8IWQ3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRSK2Q8IWQ3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRSK2Q8IWQ3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRSK2Q8IWQ3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRSK2Q8IWQ3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRSK2Q8IWQ3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRSK2Q8IWQ3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRSK2Q8IWQ3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRSK2Q8IWQ3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRSK2Q8IWQ3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRSK2Q8IWQ3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRSK2Q8IWQ3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRSK2Q8IWQ3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRSK2Q8IWQ3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRSK2Q8IWQ3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRSK2Q8IWQ3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRSK2Q8IWQ3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRSK2Q8IWQ3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRSK2Q8IWQ3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRSK2Q8IWQ3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRSK2Q8IWQ3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRSK2Q8IWQ3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRSK2Q8IWQ3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRSK2Q8IWQ3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRSK2Q8IWQ3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRSK2Q8IWQ3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRSK2Q8IWQ3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRSK2Q8IWQ3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRSK2Q8IWQ3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRSK2Q8IWQ3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRSK2Q8IWQ3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRSK2Q8IWQ3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRSK2Q8IWQ3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRSK2Q8IWQ3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRSK2Q8IWQ3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRSK2Q8IWQ3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRSK2Q8IWQ3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms