Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms