Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLD3Q8IV08 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLD3Q8IV08 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLD3Q8IV08 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLD3Q8IV08 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLD3Q8IV08 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLD3Q8IV08 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLD3Q8IV08 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLD3Q8IV08 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLD3Q8IV08 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLD3Q8IV08 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLD3Q8IV08 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLD3Q8IV08 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLD3Q8IV08 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLD3Q8IV08 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLD3Q8IV08 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLD3Q8IV08 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLD3Q8IV08 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLD3Q8IV08 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLD3Q8IV08 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLD3Q8IV08 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLD3Q8IV08 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLD3Q8IV08 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLD3Q8IV08 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLD3Q8IV08 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLD3Q8IV08 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLD3Q8IV08 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PLD3Q8IV08 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLD3Q8IV08 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLD3Q8IV08 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLD3Q8IV08 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLD3Q8IV08 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLD3Q8IV08 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLD3Q8IV08 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLD3Q8IV08 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLD3Q8IV08 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLD3Q8IV08 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLD3Q8IV08 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PLD3Q8IV08 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PLD3Q8IV08 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLD3Q8IV08 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLD3Q8IV08 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLD3Q8IV08 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLD3Q8IV08 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLD3Q8IV08 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLD3Q8IV08 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLD3Q8IV08 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLD3Q8IV08 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLD3Q8IV08 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLD3Q8IV08 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLD3Q8IV08 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLD3Q8IV08 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLD3Q8IV08 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLD3Q8IV08 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLD3Q8IV08 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLD3Q8IV08 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLD3Q8IV08 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLD3Q8IV08 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PLD3Q8IV08 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLD3Q8IV08 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLD3Q8IV08 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLD3Q8IV08 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLD3Q8IV08 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PLD3Q8IV08 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PLD3Q8IV08 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PLD3Q8IV08 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PLD3Q8IV08 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PLD3Q8IV08 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PLD3Q8IV08 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PLD3Q8IV08 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PLD3Q8IV08 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PLD3Q8IV08 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PLD3Q8IV08 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PLD3Q8IV08 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PLD3Q8IV08 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PLD3Q8IV08 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PLD3Q8IV08 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PLD3Q8IV08 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PLD3Q8IV08 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PLD3Q8IV08 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PLD3Q8IV08 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PLD3Q8IV08 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PLD3Q8IV08 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PLD3Q8IV08 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLD3Q8IV08 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLD3Q8IV08 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLD3Q8IV08 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLD3Q8IV08 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PLD3Q8IV08 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLD3Q8IV08 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLD3Q8IV08 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLD3Q8IV08 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PLD3Q8IV08 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLD3Q8IV08 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLD3Q8IV08 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PLD3Q8IV08 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLD3Q8IV08 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLD3Q8IV08 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLD3Q8IV08 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLD3Q8IV08 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms