Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
NME9Q86XW9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NME9Q86XW9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NME9Q86XW9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NME9Q86XW9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NME9Q86XW9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NME9Q86XW9 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NME9Q86XW9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NME9Q86XW9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NME9Q86XW9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NME9Q86XW9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NME9Q86XW9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NME9Q86XW9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NME9Q86XW9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NME9Q86XW9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
NME9Q86XW9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NME9Q86XW9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NME9Q86XW9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NME9Q86XW9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NME9Q86XW9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NME9Q86XW9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NME9Q86XW9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NME9Q86XW9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NME9Q86XW9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
NME9Q86XW9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NME9Q86XW9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NME9Q86XW9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NME9Q86XW9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NME9Q86XW9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NME9Q86XW9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NME9Q86XW9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NME9Q86XW9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NME9Q86XW9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
NME9Q86XW9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NME9Q86XW9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NME9Q86XW9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
NME9Q86XW9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NME9Q86XW9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NME9Q86XW9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NME9Q86XW9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NME9Q86XW9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NME9Q86XW9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NME9Q86XW9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NME9Q86XW9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NME9Q86XW9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NME9Q86XW9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NME9Q86XW9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NME9Q86XW9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NME9Q86XW9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NME9Q86XW9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NME9Q86XW9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NME9Q86XW9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NME9Q86XW9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
NME9Q86XW9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NME9Q86XW9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NME9Q86XW9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NME9Q86XW9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NME9Q86XW9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NME9Q86XW9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NME9Q86XW9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NME9Q86XW9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NME9Q86XW9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NME9Q86XW9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
NME9Q86XW9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NME9Q86XW9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NME9Q86XW9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NME9Q86XW9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NME9Q86XW9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
NME9Q86XW9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.2
NME9Q86XW9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
NME9Q86XW9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NME9Q86XW9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NME9Q86XW9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
NME9Q86XW9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NME9Q86XW9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NME9Q86XW9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NME9Q86XW9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms