Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SKAP1Q86WV1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SKAP1Q86WV1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SKAP1Q86WV1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SKAP1Q86WV1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SKAP1Q86WV1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SKAP1Q86WV1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SKAP1Q86WV1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SKAP1Q86WV1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SKAP1Q86WV1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SKAP1Q86WV1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SKAP1Q86WV1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SKAP1Q86WV1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SKAP1Q86WV1 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SKAP1Q86WV1 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SKAP1Q86WV1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SKAP1Q86WV1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SKAP1Q86WV1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SKAP1Q86WV1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SKAP1Q86WV1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SKAP1Q86WV1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SKAP1Q86WV1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SKAP1Q86WV1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SKAP1Q86WV1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SKAP1Q86WV1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SKAP1Q86WV1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SKAP1Q86WV1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SKAP1Q86WV1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SKAP1Q86WV1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SKAP1Q86WV1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SKAP1Q86WV1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SKAP1Q86WV1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SKAP1Q86WV1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SKAP1Q86WV1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SKAP1Q86WV1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SKAP1Q86WV1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SKAP1Q86WV1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SKAP1Q86WV1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SKAP1Q86WV1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SKAP1Q86WV1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SKAP1Q86WV1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SKAP1Q86WV1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SKAP1Q86WV1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SKAP1Q86WV1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SKAP1Q86WV1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SKAP1Q86WV1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SKAP1Q86WV1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SKAP1Q86WV1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SKAP1Q86WV1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SKAP1Q86WV1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SKAP1Q86WV1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SKAP1Q86WV1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SKAP1Q86WV1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SKAP1Q86WV1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SKAP1Q86WV1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SKAP1Q86WV1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SKAP1Q86WV1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SKAP1Q86WV1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SKAP1Q86WV1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SKAP1Q86WV1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SKAP1Q86WV1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SKAP1Q86WV1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SKAP1Q86WV1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SKAP1Q86WV1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SKAP1Q86WV1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SKAP1Q86WV1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SKAP1Q86WV1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SKAP1Q86WV1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SKAP1Q86WV1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SKAP1Q86WV1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SKAP1Q86WV1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SKAP1Q86WV1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SKAP1Q86WV1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SKAP1Q86WV1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SKAP1Q86WV1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SKAP1Q86WV1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SKAP1Q86WV1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SKAP1Q86WV1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SKAP1Q86WV1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SKAP1Q86WV1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SKAP1Q86WV1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SKAP1Q86WV1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SKAP1Q86WV1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SKAP1Q86WV1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SKAP1Q86WV1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SKAP1Q86WV1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SKAP1Q86WV1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SKAP1Q86WV1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SKAP1Q86WV1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SKAP1Q86WV1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SKAP1Q86WV1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SKAP1Q86WV1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SKAP1Q86WV1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SKAP1Q86WV1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SKAP1Q86WV1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SKAP1Q86WV1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SKAP1Q86WV1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SKAP1Q86WV1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SKAP1Q86WV1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SKAP1Q86WV1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms