Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

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Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
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