Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBR3Q6ZT12 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBR3Q6ZT12 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBR3Q6ZT12 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBR3Q6ZT12 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBR3Q6ZT12 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBR3Q6ZT12 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBR3Q6ZT12 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBR3Q6ZT12 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBR3Q6ZT12 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
UBR3Q6ZT12 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
UBR3Q6ZT12 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBR3Q6ZT12 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
UBR3Q6ZT12 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
UBR3Q6ZT12 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
UBR3Q6ZT12 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
UBR3Q6ZT12 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
UBR3Q6ZT12 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
UBR3Q6ZT12 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
UBR3Q6ZT12 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
UBR3Q6ZT12 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
UBR3Q6ZT12 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
UBR3Q6ZT12 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
UBR3Q6ZT12 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
UBR3Q6ZT12 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
UBR3Q6ZT12 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
UBR3Q6ZT12 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
UBR3Q6ZT12 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
UBR3Q6ZT12 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
UBR3Q6ZT12 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
UBR3Q6ZT12 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
UBR3Q6ZT12 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
UBR3Q6ZT12 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC27■■□□□ 1.91
UBR3Q6ZT12 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
UBR3Q6ZT12 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
UBR3Q6ZT12 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
UBR3Q6ZT12 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
UBR3Q6ZT12 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
UBR3Q6ZT12 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
UBR3Q6ZT12 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
UBR3Q6ZT12 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
UBR3Q6ZT12 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBR3Q6ZT12 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBR3Q6ZT12 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBR3Q6ZT12 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBR3Q6ZT12 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
UBR3Q6ZT12 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBR3Q6ZT12 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBR3Q6ZT12 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBR3Q6ZT12 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBR3Q6ZT12 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBR3Q6ZT12 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBR3Q6ZT12 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBR3Q6ZT12 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
UBR3Q6ZT12 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBR3Q6ZT12 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBR3Q6ZT12 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBR3Q6ZT12 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBR3Q6ZT12 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBR3Q6ZT12 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBR3Q6ZT12 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBR3Q6ZT12 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBR3Q6ZT12 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
UBR3Q6ZT12 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBR3Q6ZT12 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBR3Q6ZT12 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBR3Q6ZT12 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBR3Q6ZT12 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
UBR3Q6ZT12 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBR3Q6ZT12 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBR3Q6ZT12 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBR3Q6ZT12 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBR3Q6ZT12 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBR3Q6ZT12 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBR3Q6ZT12 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBR3Q6ZT12 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBR3Q6ZT12 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
UBR3Q6ZT12 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
UBR3Q6ZT12 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
UBR3Q6ZT12 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
UBR3Q6ZT12 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
UBR3Q6ZT12 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
UBR3Q6ZT12 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
UBR3Q6ZT12 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
UBR3Q6ZT12 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBR3Q6ZT12 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBR3Q6ZT12 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBR3Q6ZT12 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBR3Q6ZT12 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBR3Q6ZT12 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
UBR3Q6ZT12 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBR3Q6ZT12 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBR3Q6ZT12 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBR3Q6ZT12 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBR3Q6ZT12 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBR3Q6ZT12 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBR3Q6ZT12 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBR3Q6ZT12 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBR3Q6ZT12 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
UBR3Q6ZT12 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
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